Содержание ДНК Bordetella pertussis в носоглоточных мазках детей и взрослых, позитивных в ПЦР реального времени

В. Л. Колодкина, В. С. Мартынов ГУ «Республиканский научно-практический центр эпидемиологии и микробиологии»

2017 №1 | Оригинальные научные публикации

Аннотация

Список литературы

Проведен сравнительный анализ содержания ДНК B. pertussis в 351 носоглоточном мазке лиц разного возраста, позитивных в ПЦР реального времени. Относительное количество ДНК оценивали по значению CT в TaqMan ПЦР реального времени с праймерами к IS481. Достоверно более высокое содержание ДНК отмечалось в носоглоточных мазках детей в возрасте младше 11 месяцев (p < 0.05). Среднее значение CT в этой группе лиц составляло 32,4 против значений 35,6; 35,0; 37,7; 37,1 в возрастных группах 1–4, 5–9, 10–14, 15–80 лет, соответственно. Среднее значение CT в позитивных образцах, взятых в период html5-dom-document-internal-entity2-8805-end 15 дней от начала кашля, были достоверно выше в сравнении с образцами, взятыми в острый период заболевания (html5-dom-document-internal-entity2-8804-end 14 дней) во всех возрастных группах, исключая детей первого года жизни. Полученные данные свидетельствуют о положительной связи содержания ДНК B. pertussis в носоглоточных мазках с возрастом пациента и о более быстрой элиминации ДНК из носоглотки у детей старших возрастных групп, подростков и взрослых в отличие от детей первого года жизни.

Ключевые слова:

коклюш, Bordetella pertussis, носоглоточный мазок, TaqMan ПЦР реального времени, содержание ДНК

Content of bordetella pertussis DNA in nasopharyngeal swab from children and adults positive in real-time PCR

A comparative analysis of B. pertussis DNA content in 351 nasopharyngeal swabs from persons of different age positive in real-time PCR was conducted. The DNA content was measured by quantitative IS481 TaqMan real-time PCR. The content of B. pertussis was significantly higher in infant less than 11 months old (p < 0.05). The mean Ct value in this age group was 32.4 against mean Ct value the values 35.6; 35.0; 37.7; 37.1 in the age groups 1–4, 5–9, 10–14, 15–80 years respectively. The mean Ct value in the PCR positive nasopharyngeal swabs taken in the range of html5-dom-document-internal-entity2-8805-end 15 days of onset of cough were significantly higher compared with swabs taken during the acute phase of the disease (html5-dom-document-internal-entity2-8804-end 14 days) in all age groups except infants. The findings suggest that B. pertussis DNA content in nasopharyngeal swabs is correlated with patient age and that DNA elimination from the nasopharynx of children older age groups, teenagers and adults is more rapid than children of the first year.

Keywords

pertussis, Bordetella pertussis, nasopharyngeal swab, TaqMan real-time PCR, DNA content

1. Curran, T., Coyle P. V. Understanding the true burden and infection dynamics of Bordetella pertussis using molecular diagnostics // J. Infect. – 2016. – Vol. 01. – P. 1–3.
2. Dragsted, D. M., Dohn B., Madsen J., Jensen J. S. Comparison of culture and PCR for detection of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis under routine laboratoty conditions // J. Med. Microbiol. – 2004. – Vol. 53. – P. 749–754.
3. Fry, N. K., Duncan J., Wanger K. et al. Role PCR in the diagnosis of pertussis infection in infants: 5 years’ experience of provision of a same-day real-time PCR service in England and Wales from 2002 to 2007 / J. Med. Microbiol. – 2009. – Vol. 58. – P. 1023–1029.
4. Kolodkina, V., Martynov V., Babenko A. Multiplex real-time PCR assay for detection and differentiation of Bordetella pertussis and Bordetella parapertussis // Iran J. Microbiol. – 2014. – № 3, vol. 6. – P. 140–148.
5. Marcon, M. J., Hamoudi A. C., Cannon H. J., Hribar M. M. Comparison of Throat and Nasopharyngeal Swab Specimens for Culture Diagnosis of Bordetella pertussis Infection // J. Clin. Microbiol. – 1987. – Vol. 25. – P. 1109–1110.
6. Nakamura, Y., Kamachi K., Toyoizumi-Ajisaka H., Otsuka N., Saito R., Tsuruoka J., Katsuta T., Nakajima K., Okada K., Kato T., Arakawa Y. Marked difference between adult and children in Bordetella pertussis DNA load in nasopharyngeal swabs // Infect. Clin. Microbiol. – 2011. – Vol. 173. – P. 365–370.
7. Riffelmann, M., von Konig C. H.,Caro V., Guiso N. Nucleic acid amplification tests for diagnosis of Bordetella infections // J. Clin. Microbiol. – 2005. – Vol. 43. – P. 4925–4929.
8. Wood, N., McIntyre P. Pertussis: review of epidemiology, diagnosis, management and prevention // Pediatrics Respiratory Reviews. – 2008. – Vol. 9. – P. 201–212.