Возможности исследования предрасположенности к раннему алкоголизму на основе технологии ДНК-биочипов

А. В. Копытов, Л. П. Титов, К. И. Павлов РНПЦ психического здоровья, РНПЦ эпидемиологии и микробиологии

2013 №4 | Клинический обзор

Аннотация

Список литературы

Представлены возможности технологии ДНК-биочипов для исследования предрасположенности к формированию раннего синдрома зависимости от алкоголя. Суммированы подходы по верификации данных, получаемых при исследовании транскриптома пациентов. Показаны возможности использования клеток периферической крови для скринингового ДНК-биочипирования и поиска новых мишеней лекарственного воздействия при синдроме зависимости от алкоголя.

Ключевые слова:

ДНК-микрочипов, синдром зависимости от алкоголя, метаболизм этанола, биоинформатика

Research opportunities to early alcoholism progredience diagnostics on the basis of dna-microarray technology

Possibilities of DNA microarray technology to study predisposition to the formation of early alcohol dependence syndrome. Summarizes approaches to the verification of data obtained in the study of the transcriptome of patients. The possibilities of using peripheral blood cells for screening DNA biochipirovaniya and the search for new drug targets if the impact of alcohol dependence syndrome.

Keywords

DNA-microarray, Alcohol dependence syndrome, ethanol metabolic pathways, bioinformatics

1. Копытов, А.В., Объедков В.Г. Популяционная аутентичность синдрома алкогольной зависимости у молодых людей и подростков мужского пола/ Медицинские новости. – 2012, № 5. – с. 69-72.
2. Копытов, А.В., Объедков В.Г., Голоенко И.М. Результаты первого молекулярно-генетического исследования клинического феномена прогредиентности алкогольной зависимости у подростков и молодых людей мужского пола Республики Беларусь/ Актуальные вопросы диагностики, терапии и реабилитации психических и поведенческих расстройств: материалы международной конференции [на русском, английском языках]//ред. кол. В.А. Снежицкий, В.В. Воробьев, В.В. Зинчук; отв. ред. В.А. Карпюк. – Гродно: ГрГМУ, 2012. – 138-141 с.
3. Титов, Л. П. Современные тенденции развития медицинской науки и факторы, способствующие профессиональному росту молодых исследователей/ Л. П. Титов //Здравоохранение. - 2012 - № 7-С. 55-61.
4. Hassan, S. (2003) Pharmacogenomic analysis of mechanisms mediating ethanol regulation of dopamine beta-hydroxylase/ S. Hassan [et al.]// Biol. Chem. – 2003. – Vol.278. – P. 38860–38869.
5. Lewohl, J. M. Gene expression in human alcoholism: microarray analysis of frontal cortex/ Lewohl, J. M. [et al.]// Alcohol. Clin. Exp. Res. – 2000. – Vol.24. – P. 1873–1882.
6. Mayfield, R. D. Patterns of gene expression are altered in the frontal and motor cortices of human alcoholics/ R. D. Mayfield// J. Neurochem. – 2002. – Vol. 81. – P. 802–813.
7. Bailey, S. M. Chronic ethanol consumption alters the glutathione/glutathione peroxidase-1 system and protein oxidation status in rat liver/ Bailey, S. M. [et al.] // Alcohol. Clin. Exp. Res. – 2001. - Vol. 25. - P. 726–733.
8. Laura E. N. Alcohol: Methods and Protocols/ Laura E. N. [et al.]// Methods in Molecular Biology. – 2008. - Vol. 447. – P. 337-346/
9. Schena, M. Quantitative monitoring of gene expression patterns with a complementary DNA microarray/ Schena, M. [et al.]// Science. - 1995. – Vol. 270. – P. 467–470.
10. Pinkel, D. Array comparative genomic hybridization and its applications in cancer/ D. Pinkel, D. G Albertson// Nat. Genet. – 2005. – Suppl. 37. - S. 11–17.
11. Utilization of microarray platforms in clinical practice/ F. AlMulla //Methods Mol Biol. – 2007. – Vol. 382. – P. 115–136.
12. Kallioniemi, A. Comparative genomic hybridization for molecular cytogenetic analysis of solid tumors/ Kallioniemi, A. [et al.]// Science. 1992. – Vol. 258. – P. 818–821.
13. Copland, J.A. The use of DNA microarrays to assess clinical samples: the transition from bedside to bench to bed-side/ J.A. Copland [et al.]// Recent Prog. Horm. Res. - 2003. – Vol.. 58. – P. 25–53.
14. Arrayit Corporation [Электронный ресурс]. - 2013. - Режим доступа: http://arrayit.com/ Дата доступа: 26.08.2013
15. Dufva, M. DNA Microarrays for Biomedical Research. Methods and Protocols/ M. Dufva, [et al.]// Methods in Molecular Biology.- 2009. - Vol. 529. – P. 34-48.
16. Rampal, J.B. DNA Arrays Methods and Protocols Methods and Protocols/ J.B. Rampal [et al.]//Methods in Molecular Biology. – 1999. - Vol. 170. – P. 345-357.
17. Talwar, S. Suffredini Gene expression profiles of peripheral blood leukocytes after endotoxin challenge in humans/ S. Talwar [et al.]// Physiol. Genomics. – 2006. – Vol. 25. – P. 203-215,.
18. Treadwell, J. A. Microarray analysis of mouse brain gene expression following acute ethanol treatment/ J. A. Treadwell, S. M. Singh //Neurochem. Res. – 2004. - Vol. 29. – Vol. 357–369.
19. Furukawa, M. Cytochrome P450 gene expression levels in peripheral blood mononuclear cells in comparison with the liver/ M. Furukawa [et al.]// Cancer Sci. – 2004. - Vol. 95, №6. - P. 520-529.
20. KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes/ [Электронный ресурс]. - 2013. - Режим доступа: (http://www.genome. jp/kegg/ Дата доступа: 25.08.2013
21. The Comprehensive Enzyme Information System BRENDA / [Электронный ресурс]. - 2013. - Режим доступа: (http://www.brendaenzymes.org/ Дата доступа: 25.08.2013
22. Sheth, P. Epidermal growth factor prevents acetaldehyde-induced disruption of tight junctions in Caco-2 cell monolayer/ P. Sheth// Alcohol. Clin. Exp. Res. 2004. – Vol. 28. - P. 797–804.